Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chd1P40201 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chd1P40201 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chd1P40201 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chd1P40201 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chd1P40201 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chd1P40201 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chd1P40201 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Chd1P40201 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chd1P40201 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms