Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PpargP37238 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PpargP37238 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PpargP37238 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PpargP37238 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PpargP37238 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PpargP37238 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PpargP37238 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PpargP37238 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PpargP37238 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PpargP37238 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PpargP37238 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PpargP37238 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PpargP37238 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PpargP37238 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PpargP37238 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PpargP37238 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PpargP37238 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PpargP37238 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PpargP37238 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PpargP37238 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PpargP37238 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PpargP37238 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PpargP37238 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PpargP37238 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PpargP37238 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PpargP37238 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PpargP37238 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PpargP37238 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PpargP37238 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PpargP37238 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PpargP37238 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PpargP37238 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PpargP37238 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PpargP37238 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PpargP37238 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PpargP37238 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PpargP37238 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PpargP37238 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PpargP37238 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PpargP37238 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PpargP37238 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PpargP37238 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PpargP37238 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PpargP37238 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PpargP37238 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PpargP37238 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PpargP37238 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PpargP37238 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PpargP37238 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PpargP37238 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PpargP37238 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PpargP37238 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PpargP37238 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PpargP37238 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PpargP37238 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PpargP37238 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PpargP37238 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PpargP37238 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PpargP37238 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PpargP37238 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PpargP37238 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PpargP37238 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PpargP37238 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PpargP37238 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PpargP37238 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PpargP37238 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PpargP37238 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PpargP37238 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PpargP37238 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PpargP37238 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PpargP37238 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PpargP37238 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PpargP37238 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PpargP37238 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PpargP37238 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PpargP37238 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PpargP37238 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PpargP37238 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PpargP37238 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PpargP37238 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PpargP37238 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PpargP37238 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PpargP37238 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PpargP37238 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PpargP37238 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PpargP37238 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PpargP37238 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PpargP37238 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PpargP37238 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PpargP37238 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PpargP37238 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PpargP37238 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PpargP37238 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PpargP37238 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PpargP37238 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PpargP37238 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PpargP37238 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PpargP37238 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PpargP37238 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms