Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprkP35822 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprkP35822 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprkP35822 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprkP35822 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprkP35822 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PtprkP35822 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtprkP35822 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprkP35822 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprkP35822 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprkP35822 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms