Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpardP35396 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpardP35396 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpardP35396 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpardP35396 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PpardP35396 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpardP35396 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpardP35396 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PpardP35396 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PpardP35396 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PpardP35396 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpardP35396 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpardP35396 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpardP35396 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpardP35396 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpardP35396 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpardP35396 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpardP35396 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpardP35396 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpardP35396 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpardP35396 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpardP35396 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpardP35396 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PpardP35396 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PpardP35396 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PpardP35396 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PpardP35396 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PpardP35396 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PpardP35396 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PpardP35396 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PpardP35396 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PpardP35396 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PpardP35396 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PpardP35396 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PpardP35396 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PpardP35396 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PpardP35396 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PpardP35396 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PpardP35396 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PpardP35396 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PpardP35396 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PpardP35396 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PpardP35396 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PpardP35396 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PpardP35396 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PpardP35396 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PpardP35396 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PpardP35396 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PpardP35396 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PpardP35396 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PpardP35396 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpardP35396 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpardP35396 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpardP35396 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpardP35396 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpardP35396 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpardP35396 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpardP35396 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpardP35396 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpardP35396 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpardP35396 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpardP35396 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpardP35396 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PpardP35396 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PpardP35396 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpardP35396 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpardP35396 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpardP35396 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpardP35396 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpardP35396 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpardP35396 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpardP35396 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpardP35396 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpardP35396 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpardP35396 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpardP35396 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpardP35396 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpardP35396 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpardP35396 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpardP35396 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpardP35396 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpardP35396 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpardP35396 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpardP35396 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpardP35396 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpardP35396 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpardP35396 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpardP35396 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpardP35396 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpardP35396 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpardP35396 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpardP35396 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpardP35396 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PpardP35396 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PpardP35396 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PpardP35396 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpardP35396 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PpardP35396 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PpardP35396 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpardP35396 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms