Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab20P35295 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab20P35295 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab20P35295 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab20P35295 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rab20P35295 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab20P35295 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab20P35295 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab20P35295 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab20P35295 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab20P35295 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab20P35295 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab20P35295 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab20P35295 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab20P35295 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab20P35295 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab20P35295 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab20P35295 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rab20P35295 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab20P35295 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab20P35295 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab20P35295 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab20P35295 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab20P35295 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab20P35295 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab20P35295 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab20P35295 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab20P35295 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab20P35295 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab20P35295 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab20P35295 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab20P35295 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rab20P35295 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab20P35295 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab20P35295 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab20P35295 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab20P35295 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab20P35295 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab20P35295 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab20P35295 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab20P35295 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab20P35295 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab20P35295 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab20P35295 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rab20P35295 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab20P35295 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab20P35295 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab20P35295 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab20P35295 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Rab20P35295 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab20P35295 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab20P35295 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab20P35295 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab20P35295 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab20P35295 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab20P35295 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab20P35295 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab20P35295 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab20P35295 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab20P35295 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rab20P35295 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab20P35295 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab20P35295 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab20P35295 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab20P35295 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rab20P35295 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rab20P35295 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rab20P35295 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab20P35295 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab20P35295 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab20P35295 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab20P35295 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab20P35295 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab20P35295 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab20P35295 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rab20P35295 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab20P35295 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab20P35295 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rab20P35295 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab20P35295 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab20P35295 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab20P35295 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab20P35295 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab20P35295 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab20P35295 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab20P35295 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab20P35295 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab20P35295 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab20P35295 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab20P35295 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab20P35295 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rab20P35295 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab20P35295 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab20P35295 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab20P35295 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab20P35295 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab20P35295 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab20P35295 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab20P35295 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab20P35295 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.5 ms