Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprmP28828 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprmP28828 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprmP28828 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprmP28828 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprmP28828 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprmP28828 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtprmP28828 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprmP28828 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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