Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfraP26618 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfraP26618 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfraP26618 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfraP26618 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfraP26618 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfraP26618 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfraP26618 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfraP26618 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfraP26618 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfraP26618 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfraP26618 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfraP26618 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfraP26618 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfraP26618 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfraP26618 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfraP26618 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfraP26618 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfraP26618 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfraP26618 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfraP26618 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfraP26618 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfraP26618 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PdgfraP26618 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfraP26618 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfraP26618 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfraP26618 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfraP26618 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfraP26618 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfraP26618 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfraP26618 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfraP26618 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfraP26618 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfraP26618 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfraP26618 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfraP26618 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfraP26618 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfraP26618 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfraP26618 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfraP26618 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfraP26618 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfraP26618 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PdgfraP26618 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfraP26618 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfraP26618 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfraP26618 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfraP26618 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfraP26618 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfraP26618 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfraP26618 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfraP26618 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfraP26618 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfraP26618 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfraP26618 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PdgfraP26618 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfraP26618 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfraP26618 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfraP26618 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfraP26618 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfraP26618 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfraP26618 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfraP26618 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfraP26618 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfraP26618 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfraP26618 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfraP26618 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfraP26618 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfraP26618 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfraP26618 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfraP26618 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfraP26618 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfraP26618 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfraP26618 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfraP26618 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfraP26618 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfraP26618 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfraP26618 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfraP26618 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfraP26618 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfraP26618 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PdgfraP26618 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfraP26618 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PdgfraP26618 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfraP26618 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfraP26618 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PdgfraP26618 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PdgfraP26618 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfraP26618 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfraP26618 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfraP26618 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PdgfraP26618 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PdgfraP26618 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PdgfraP26618 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PdgfraP26618 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PdgfraP26618 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PdgfraP26618 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PdgfraP26618 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PdgfraP26618 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PdgfraP26618 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PdgfraP26618 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.3 ms