Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CftrP26361 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CftrP26361 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CftrP26361 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CftrP26361 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CftrP26361 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CftrP26361 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CftrP26361 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CftrP26361 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CftrP26361 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CftrP26361 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CftrP26361 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CftrP26361 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CftrP26361 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CftrP26361 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CftrP26361 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CftrP26361 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CftrP26361 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CftrP26361 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CftrP26361 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CftrP26361 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CftrP26361 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CftrP26361 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CftrP26361 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CftrP26361 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CftrP26361 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CftrP26361 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CftrP26361 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CftrP26361 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CftrP26361 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CftrP26361 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CftrP26361 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CftrP26361 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CftrP26361 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CftrP26361 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CftrP26361 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CftrP26361 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CftrP26361 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CftrP26361 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CftrP26361 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CftrP26361 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CftrP26361 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CftrP26361 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CftrP26361 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CftrP26361 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CftrP26361 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CftrP26361 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CftrP26361 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CftrP26361 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CftrP26361 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CftrP26361 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CftrP26361 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CftrP26361 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CftrP26361 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CftrP26361 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CftrP26361 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CftrP26361 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CftrP26361 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CftrP26361 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CftrP26361 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CftrP26361 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CftrP26361 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CftrP26361 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CftrP26361 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CftrP26361 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CftrP26361 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CftrP26361 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CftrP26361 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CftrP26361 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CftrP26361 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CftrP26361 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CftrP26361 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CftrP26361 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CftrP26361 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CftrP26361 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CftrP26361 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CftrP26361 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CftrP26361 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CftrP26361 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CftrP26361 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CftrP26361 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CftrP26361 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CftrP26361 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CftrP26361 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CftrP26361 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CftrP26361 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CftrP26361 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CftrP26361 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CftrP26361 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CftrP26361 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CftrP26361 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CftrP26361 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CftrP26361 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CftrP26361 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CftrP26361 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CftrP26361 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CftrP26361 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CftrP26361 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CftrP26361 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CftrP26361 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms