Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms