Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms