Protein–RNA interactions for Protein: P11672

Lcn2, Neutrophil gelatinase-associated lipocalin, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn2P11672 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lcn2P11672 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms