Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
P10404 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
P10404 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
P10404 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
P10404 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
P10404 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
P10404 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
P10404 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
P10404 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
P10404 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
P10404 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
P10404 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
P10404 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
P10404 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
P10404 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
P10404 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
P10404 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
P10404 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
P10404 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
P10404 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
P10404 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
P10404 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
P10404 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
P10404 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
P10404 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
P10404 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
P10404 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
P10404 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
P10404 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
P10404 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
P10404 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
P10404 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
P10404 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
P10404 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
P10404 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
P10404 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
P10404 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
P10404 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
P10404 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
P10404 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
P10404 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
P10404 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
P10404 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
P10404 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
P10404 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
P10404 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
P10404 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
P10404 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
P10404 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
P10404 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
P10404 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
P10404 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
P10404 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
P10404 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
P10404 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
P10404 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
P10404 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
P10404 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
P10404 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
P10404 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
P10404 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
P10404 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
P10404 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
P10404 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
P10404 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
P10404 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
P10404 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
P10404 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
P10404 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
P10404 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
P10404 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
P10404 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
P10404 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
P10404 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
P10404 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
P10404 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
P10404 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
P10404 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
P10404 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
P10404 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
P10404 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
P10404 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
P10404 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
P10404 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
P10404 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
P10404 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
P10404 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
P10404 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
P10404 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
P10404 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
P10404 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
P10404 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
P10404 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
P10404 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
P10404 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
P10404 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
P10404 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
P10404 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
P10404 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
P10404 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms