Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf1P09925 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf1P09925 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Surf1P09925 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Surf1P09925 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Surf1P09925 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Surf1P09925 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Surf1P09925 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf1P09925 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf1P09925 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf1P09925 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms