Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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