Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spta1P08032 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spta1P08032 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Spta1P08032 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Spta1P08032 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Spta1P08032 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Spta1P08032 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Spta1P08032 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms