Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfrbP05622 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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