Protein–RNA interactions for Protein: P01734

T-cell receptor beta chain V region 3H.25, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01734 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01734 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01734 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01734 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01734 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01734 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01734 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01734 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P01734 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P01734 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P01734 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01734 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01734 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01734 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01734 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01734 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01734 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01734 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01734 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01734 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01734 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01734 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01734 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01734 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01734 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01734 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01734 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01734 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01734 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01734 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01734 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01734 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01734 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01734 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01734 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01734 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01734 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01734 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01734 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01734 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01734 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01734 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01734 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01734 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01734 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01734 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01734 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01734 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01734 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01734 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01734 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01734 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01734 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01734 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01734 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01734 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01734 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01734 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01734 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01734 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01734 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01734 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01734 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01734 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01734 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01734 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01734 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P01734 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P01734 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01734 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01734 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P01734 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01734 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01734 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01734 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01734 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01734 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01734 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01734 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01734 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01734 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01734 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01734 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01734 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P01734 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01734 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01734 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01734 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01734 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01734 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01734 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01734 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01734 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01734 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01734 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01734 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01734 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01734 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01734 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01734 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms