Protein–RNA interactions for Protein: P01653

Ig kappa chain V-V region W3082, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01653 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01653 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01653 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01653 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01653 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01653 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01653 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01653 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01653 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01653 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01653 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01653 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01653 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01653 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01653 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01653 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01653 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01653 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01653 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01653 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01653 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01653 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01653 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
P01653 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01653 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01653 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01653 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
P01653 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01653 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
P01653 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01653 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01653 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01653 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01653 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01653 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01653 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01653 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01653 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01653 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01653 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01653 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01653 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01653 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01653 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01653 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01653 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01653 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01653 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01653 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01653 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01653 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
P01653 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
P01653 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01653 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
P01653 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01653 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
P01653 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
P01653 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01653 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01653 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01653 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01653 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01653 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01653 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
P01653 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01653 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01653 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P01653 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01653 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01653 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01653 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01653 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
P01653 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01653 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01653 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01653 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01653 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.02■□□□□ -0
P01653 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01653 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01653 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
P01653 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01653 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01653 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
P01653 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
P01653 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01653 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01653 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
P01653 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01653 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01653 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01653 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01653 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01653 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01653 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01653 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01653 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01653 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01653 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01653 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
P01653 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms