Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BlmO88700 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BlmO88700 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BlmO88700 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BlmO88700 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BlmO88700 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BlmO88700 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BlmO88700 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BlmO88700 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BlmO88700 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BlmO88700 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BlmO88700 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BlmO88700 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BlmO88700 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BlmO88700 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BlmO88700 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BlmO88700 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BlmO88700 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BlmO88700 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BlmO88700 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BlmO88700 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BlmO88700 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BlmO88700 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BlmO88700 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BlmO88700 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BlmO88700 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BlmO88700 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BlmO88700 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BlmO88700 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BlmO88700 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BlmO88700 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BlmO88700 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BlmO88700 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BlmO88700 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BlmO88700 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BlmO88700 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BlmO88700 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BlmO88700 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BlmO88700 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BlmO88700 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BlmO88700 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BlmO88700 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BlmO88700 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BlmO88700 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BlmO88700 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BlmO88700 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BlmO88700 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BlmO88700 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BlmO88700 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BlmO88700 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BlmO88700 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BlmO88700 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BlmO88700 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BlmO88700 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BlmO88700 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BlmO88700 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BlmO88700 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BlmO88700 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BlmO88700 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BlmO88700 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BlmO88700 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BlmO88700 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BlmO88700 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BlmO88700 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BlmO88700 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BlmO88700 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BlmO88700 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BlmO88700 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BlmO88700 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BlmO88700 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BlmO88700 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BlmO88700 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BlmO88700 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BlmO88700 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BlmO88700 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BlmO88700 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BlmO88700 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BlmO88700 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BlmO88700 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BlmO88700 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BlmO88700 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BlmO88700 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BlmO88700 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BlmO88700 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BlmO88700 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BlmO88700 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BlmO88700 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BlmO88700 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BlmO88700 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BlmO88700 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BlmO88700 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BlmO88700 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BlmO88700 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BlmO88700 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BlmO88700 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BlmO88700 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BlmO88700 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BlmO88700 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BlmO88700 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BlmO88700 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms