Protein–RNA interactions for Protein: O88255

Gm10509, Mszf57 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10509O88255 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Gm10509O88255 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Gm10509O88255 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Gm10509O88255 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Gm10509O88255 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Gm10509O88255 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Gm10509O88255 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Gm10509O88255 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Gm10509O88255 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
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Gm10509O88255 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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