Protein–RNA interactions for Protein: O54965

Rnf13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, mousemouse

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf13O54965 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf13O54965 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf13O54965 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf13O54965 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf13O54965 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf13O54965 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf13O54965 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf13O54965 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf13O54965 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf13O54965 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf13O54965 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf13O54965 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf13O54965 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf13O54965 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf13O54965 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf13O54965 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf13O54965 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf13O54965 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf13O54965 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf13O54965 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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Rnf13O54965 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Rnf13O54965 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Rnf13O54965 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Rnf13O54965 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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