Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms