Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nek2O35942 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nek2O35942 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nek2O35942 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek2O35942 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek2O35942 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek2O35942 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek2O35942 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nek2O35942 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms