Protein–RNA interactions for Protein: O35887

Calu, Calumenin, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaluO35887 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CaluO35887 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CaluO35887 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CaluO35887 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CaluO35887 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CaluO35887 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CaluO35887 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CaluO35887 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CaluO35887 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CaluO35887 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CaluO35887 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CaluO35887 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CaluO35887 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CaluO35887 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CaluO35887 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CaluO35887 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CaluO35887 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CaluO35887 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CaluO35887 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CaluO35887 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CaluO35887 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CaluO35887 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CaluO35887 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CaluO35887 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CaluO35887 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CaluO35887 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CaluO35887 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CaluO35887 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CaluO35887 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CaluO35887 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CaluO35887 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CaluO35887 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CaluO35887 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CaluO35887 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CaluO35887 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CaluO35887 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CaluO35887 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CaluO35887 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CaluO35887 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CaluO35887 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CaluO35887 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CaluO35887 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CaluO35887 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CaluO35887 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CaluO35887 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CaluO35887 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CaluO35887 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CaluO35887 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CaluO35887 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CaluO35887 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CaluO35887 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CaluO35887 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CaluO35887 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CaluO35887 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CaluO35887 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CaluO35887 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CaluO35887 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CaluO35887 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CaluO35887 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CaluO35887 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CaluO35887 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CaluO35887 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CaluO35887 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CaluO35887 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CaluO35887 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CaluO35887 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CaluO35887 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CaluO35887 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CaluO35887 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CaluO35887 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CaluO35887 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CaluO35887 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CaluO35887 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CaluO35887 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CaluO35887 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CaluO35887 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CaluO35887 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CaluO35887 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CaluO35887 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CaluO35887 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CaluO35887 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CaluO35887 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CaluO35887 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CaluO35887 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CaluO35887 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CaluO35887 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CaluO35887 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CaluO35887 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CaluO35887 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CaluO35887 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CaluO35887 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CaluO35887 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CaluO35887 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CaluO35887 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CaluO35887 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CaluO35887 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CaluO35887 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CaluO35887 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CaluO35887 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CaluO35887 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms