Protein–RNA interactions for Protein: J3QN14

Zfp616, Zinc finger protein 616, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp616J3QN14 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zfp616J3QN14 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms