Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Gm20830J3KML6 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Gm20830J3KML6 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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