Protein–RNA interactions for Protein: I6L9G2

Gm42641, 6620401K05Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm42641I6L9G2 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm42641I6L9G2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm42641I6L9G2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm42641I6L9G2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm42641I6L9G2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm42641I6L9G2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm42641I6L9G2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm42641I6L9G2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm42641I6L9G2 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm42641I6L9G2 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm42641I6L9G2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm42641I6L9G2 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm42641I6L9G2 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm42641I6L9G2 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms