Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn34aG3UW52 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn34aG3UW52 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn34aG3UW52 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn34aG3UW52 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn34aG3UW52 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn34aG3UW52 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34aG3UW52 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms