Protein–RNA interactions for Protein: F8VPT3

Lct, Lactase, mousemouse

Predictions only

Length 1,931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LctF8VPT3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LctF8VPT3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LctF8VPT3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LctF8VPT3 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LctF8VPT3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LctF8VPT3 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LctF8VPT3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LctF8VPT3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LctF8VPT3 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LctF8VPT3 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LctF8VPT3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LctF8VPT3 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LctF8VPT3 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LctF8VPT3 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LctF8VPT3 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LctF8VPT3 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LctF8VPT3 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LctF8VPT3 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LctF8VPT3 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LctF8VPT3 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LctF8VPT3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LctF8VPT3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LctF8VPT3 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LctF8VPT3 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LctF8VPT3 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LctF8VPT3 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LctF8VPT3 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LctF8VPT3 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LctF8VPT3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LctF8VPT3 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LctF8VPT3 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms