Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Igkv1-99F6XWB2 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms