Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Urb2E9Q7L1 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms