Protein–RNA interactions for Protein: E9PUU5

Zfp839, Zinc finger protein 839, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp839E9PUU5 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms