Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5F7

Gm20521, Predicted gene 20521, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20521D3Z5F7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm20521D3Z5F7 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms