Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc6D3YZP9 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
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