Protein–RNA interactions for Protein: D3YVI9

Trim30c, Tripartite motif-containing 30C, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30cD3YVI9 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms