Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms