Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms