Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC28.33■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC28.33■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms