Protein–RNA interactions for Protein: B2RUR8

Otud7b, OTU domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud7bB2RUR8 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms