Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Hormad1-203ENSMUST00000107154 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Cgrrf1-203ENSMUST00000133989 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Olfr1385-201ENSMUST00000071807 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 E130114P18Rik-201ENSMUST00000107067 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Gm20821-201ENSMUST00000179829 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 AC160962.2-201ENSMUST00000224761 632 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms