Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms