Protein–RNA interactions for Protein: B2RRF6

Znf518a, Zinc finger protein 518A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518aB2RRF6 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf518aB2RRF6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf518aB2RRF6 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf518aB2RRF6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf518aB2RRF6 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf518aB2RRF6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf518aB2RRF6 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Znf518aB2RRF6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Znf518aB2RRF6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Znf518aB2RRF6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Znf518aB2RRF6 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Znf518aB2RRF6 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Znf518aB2RRF6 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Znf518aB2RRF6 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Znf518aB2RRF6 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Znf518aB2RRF6 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Znf518aB2RRF6 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Znf518aB2RRF6 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Znf518aB2RRF6 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Znf518aB2RRF6 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Znf518aB2RRF6 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Znf518aB2RRF6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf518aB2RRF6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms