Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms