Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

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Length 187 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Prr29B1ARI9 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Prr29B1ARI9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prr29B1ARI9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prr29B1ARI9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prr29B1ARI9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prr29B1ARI9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr29B1ARI9 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr29B1ARI9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr29B1ARI9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr29B1ARI9 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr29B1ARI9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr29B1ARI9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr29B1ARI9 Gm12656-201ENSMUST00000118149 577 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr29B1ARI9 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr29B1ARI9 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr29B1ARI9 Gm18692-201ENSMUST00000193047 511 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr29B1ARI9 Gm37576-201ENSMUST00000194228 372 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr29B1ARI9 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr29B1ARI9 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr29B1ARI9 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr29B1ARI9 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr29B1ARI9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr29B1ARI9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr29B1ARI9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr29B1ARI9 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr29B1ARI9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr29B1ARI9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr29B1ARI9 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr29B1ARI9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr29B1ARI9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr29B1ARI9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr29B1ARI9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr29B1ARI9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr29B1ARI9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prr29B1ARI9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prr29B1ARI9 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prr29B1ARI9 Casp8ap2-202ENSMUST00000108178 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prr29B1ARI9 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prr29B1ARI9 Gm37502-201ENSMUST00000192981 356 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prr29B1ARI9 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
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Prr29B1ARI9 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prr29B1ARI9 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prr29B1ARI9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prr29B1ARI9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prr29B1ARI9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prr29B1ARI9 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prr29B1ARI9 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prr29B1ARI9 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prr29B1ARI9 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prr29B1ARI9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prr29B1ARI9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prr29B1ARI9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prr29B1ARI9 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prr29B1ARI9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prr29B1ARI9 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prr29B1ARI9 3110062G12Rik-201ENSMUST00000192113 1419 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Prr29B1ARI9 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Prr29B1ARI9 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Prr29B1ARI9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Prr29B1ARI9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Prr29B1ARI9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Prr29B1ARI9 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prr29B1ARI9 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prr29B1ARI9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prr29B1ARI9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prr29B1ARI9 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prr29B1ARI9 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prr29B1ARI9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prr29B1ARI9 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prr29B1ARI9 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Prr29B1ARI9 Anxa10-202ENSMUST00000034054 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prr29B1ARI9 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prr29B1ARI9 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prr29B1ARI9 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prr29B1ARI9 Olfr479-201ENSMUST00000063151 1111 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prr29B1ARI9 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prr29B1ARI9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prr29B1ARI9 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prr29B1ARI9 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prr29B1ARI9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Prr29B1ARI9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prr29B1ARI9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prr29B1ARI9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prr29B1ARI9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prr29B1ARI9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prr29B1ARI9 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prr29B1ARI9 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prr29B1ARI9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prr29B1ARI9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Prr29B1ARI9 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prr29B1ARI9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prr29B1ARI9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prr29B1ARI9 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Prr29B1ARI9 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prr29B1ARI9 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prr29B1ARI9 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prr29B1ARI9 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms