Protein–RNA interactions for Protein: A7XV07

Skint8, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint8A7XV07 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Skint8A7XV07 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Skint8A7XV07 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms