Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ckap5A2AGT5 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms