Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms