Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdac6Q9Z2V5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms