Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I4

Robo3, Roundabout homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo3Q9Z2I4 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Robo3Q9Z2I4 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms