Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms